La biblioteca è stata fondata nel 1870 ed è stata integrata amministrativamente nel 1979 con la biblioteca dell'ex Istituto di mineralogia, petrografia e geochimica ed è rimasta suddivisa nelle due sezioni di Geologia e Mineralogia fino all'ottobre 2000, quando è stata riunificata anche fisicamente nei locali della sezione di Geologia e Paleontologia.
Conserva gli archivi di numerosi studiosi e alcune importanti miscellanee (Carobbi, Manasse, Aloisi).
Possiede inoltre circa 2500 carte geologiche e geografiche e un consistente fondo antico.
Complessivamente la collezione è costituita da:
La biblioteca si trova al primo piano dell'edificio in cui ha sede la Sezione di Geologia e paleontologia del Museo di storia naturale.
L'edificio è facilmente accessibile ai disabili poiché provvisto di ascensore